En la época de la Conquista, el actual estado de Oaxaca albergaba algunas de las civilizaciones más avanzadas de Mesoamérica, así como una gran diversidad de zonas ecológicas. 

La sofisticada herencia artística de sus antepasados ​​precolombinos y el esplendor de su entorno natural con una flora y fauna profusamente coloridas, debieron haber sido absorbidos por la psique de sus pobladores. Además, el particular terreno montañoso de Oaxaca mantuvo aisladas y menos aculturadas a las comunidades nativas frente al resto de la Nueva España, y las tradiciones originarias nunca fueron suprimidas por completo.

Los misioneros dominicos parecen haber alentado el deseo indígena de decorar los objetos apreciados, entre ellos los órganos. 

Los franciscanos, más austeros, influyeron en la construcción de órganos en la zona de la Ciudad de México-Puebla. Las cajas de estos órganos, en particular las de dimensiones medianas y pequeñas, estaban bien diseñadas, pero, con pocas excepciones, no estaban decoradas con el hermoso colorido de sus homólogos oaxaqueños. El estilo “barroco indígena” con el que se decoraban las iglesias de Oaxaca abarcó no solo la exuberante decoración de los órganos, sino también la de los retablos y sus ornamentos, así como la pintura interior de los templos.

En el siglo XVIII Oaxaca ya contaba con talleres de organería bien establecidos que incluían artesanos nativos talentosos. 

Los artesanos y los artistas eran anónimos por lo que probablemente nunca se conocerá su identidad, ya sea que fueran indígenas o europeos. En un taller de organería bien establecido, los organeros especializados construían los componentes mecánicos; los carpinteros expertos construían la caja; los talladores elaboraban las celosías, la decoración de las cenefas, los medallones, las guardamalletas y otros elementos ornamentales de la fachada; los doradores aplicaban la hoja de oro a las tallas y las cornisas; los pintores coloreaban los ángeles músicos, las cenefas y fondos decorativos, la ornamentación de los tubos y demás imágenes religiosas. Pero tocaba a los artistas, ya fueran criollos (españoles nacidos en México) o nativos, pintar las refinadas imágenes de los santos de la fachada de los órganos como ocurre en Zautla y Tamazulapan. Todos estos artesanos, con excepción de los organeros, también podían participar en la realización de un retablo, pero sólo el organero tenía la capacidad de crear un “retablo que pudiera cantar.”