El órgano de Santa María Suchixtlán se encontraba originalmente en otra iglesia. Un documento en la oficina municipal indica que luego fue vendido al organero oaxaqueño Jesús Cano, quien lo renovó y lo vendió a Suchixtlan en 1886. Después del terremoto de 1973, el órgano fue bajado de su tribuna durante las obras de reparación en la iglesia. Desafortunadamente, la caja apolillada se desbarató al volver a subirla a su posición original y sus piezas del órgano se dispersaron. En 2003, el IOHIO encontró tubos almacenados en el coro, el secreto utilizado en la construcción de una barda, y tallas de madera y partes de la caja en una bodega y la antigua cárcel. La gente del pueblo se llevó a casa todo lo que les resultó útil y un señor devolvió la base del clarín que había guardado porque le pareció interesante. Los componentes restantes actualmente se almacenan en el coro de la iglesia. 

El organero Jesús Cano estuvo activo en la Mixteca Alta en las décadas de 1870 y 1880, reparando y construyendo órganos. Gracias al documento de Suchixtlán, sabemos que era oriundo de la vecina comunidad de Chachoapam, donde debió tener su taller y donde una colección de tubos de órgano fue descubierta recientement en la iglesia. Jesús compuso el órgano de Tlazoyaltepec en 1871, construyó el órgano monumental de Coixtlahuaca en 1876 y modifícó el órgano de Yanhuitlán en 1886/87. Don Pantaléon Cano afinó el órgano de Yucucuí en 1876 y parece que era un pariente. 

Pedimos a las autoridades que indicaran los órganos que más se parecían al suyo en el catálogo de Banamex. Eligieron a los de Tinú y Ejutla por las tres torres, las trompetas horizontales y el color caoba de las cajas.